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《新疆维吾尔自治区基本农田保护办法》已经2000年7月6日自治区第九届人民政府第11次常务会议讨论通过，现予发布，自2000年10月1日起施行。
自治区主席 阿不来提·阿不都热西提
二000年八月七日
第一条 为了对基本农田实行特殊保护和管理，根据国家《基本农田保护条例》及有关法律、法规，结合自治区实际，制定本办法。
关联法规：国务院行政法规（1）条
第二条 本办法适用于自治区行政区域内基本农田的划定、保护和监督管理。
第三条 各级人民政府应当制定基本农田保护规划，加强基本农田保护区的基础设施建设，保障农业生产持续稳定发展。
第四条 县级以上人民政府土地行政主管部门和农业行政主管部门，按照各自的职责分工，负责本行政区域内基本农田的划定、保护和管理工作。
乡(镇)人民政府负责本行政区域内基本农田的保护管理工作。
新疆生产建设兵团系统内基本农田的划定、保护和管理工作，由其土地、农业管理机构具体负责，业务上接受自治区人民政府土地、农业行政主管部门的领导。
第五条 自治区划定的基本农田应当占全区耕地总面积的80％以上。具体数量指标根据国务院批准的自治区土地利用总体规划逐级分解下达。
第六条 下列耕地应当划入基本农田保护区：
(一)经国务院有关主管部门或者县级以上地方人民政府批准确定的粮食、棉、油生产基地的耕地；
(二)有良好的水利与水土保持设施的耕地，正在实施改造计划以及可以改造的中、低产田；
(三)蔬菜生产基地；
(四)农业科研、教学试验田；
(五)藤类瓜果、饲草饲料生产基地。
需要退耕还林、退耕还牧以及可能造成水土流失的耕地，不划入基本农田保护区。
第七条 基本农田保护区的划区定界工作，以乡(镇)为单位进行，由县级人民政府土地行政主管部门会同同级农业行政主管部门组织实施，有关部门应当配合。
第八条 划定的基本农田保护区由县级人民政府设立基本农田保护标志，予以公告。
县级人民政府土地行政主管部门应当对划定的基本农田保护区标绘图件、登记造册，建立档案，并抄送同级农业行政主管部门。
第九条 基本农田保护区划定后，由自治区人民政府组织土地行政主管部门和农业行政主管部门验收确认，或者由自治区人民政府授权自治州、市人民政府、地区行署组织土地行政主管部门和农业行政主管部门验收确认。
第十条 基本农田保护区经依法划定后，任何单位和个人不得擅自改变或者占用。确需占用基本农田的，必须经自治区人民政府审核同意后，报国务院批准。
第十一条 经批准占用基本农田的单位或者个人，按照占多少垦多少的原则，负责开垦与所占基本农田数量与质量相当的耕地。没有条件开垦或者开垦的耕地不符合要求的，应当按照一般耕地开垦费1．5倍的标准缴纳耕地开垦费。
耕地开垦费由县级以上人民政府土地行政主管部门负责收取，上缴本级财政，专项用于开垦新的耕地。
第十二条 禁止任何单位或者个人闲置、荒芜基本农田，经批准占用基本农田1年以上不满2年未动工建设的，应当按照当地耕地年产值的2倍缴纳闲置费。
第十三条 县级以上人民政府应当与下一级人民政府签订基本农田保护责任书，乡级人民政府应当与农村集体经济组织或者村民委员会签订基本农田保护责任书。
单位或者个人开发的耕地划入基本农田保护区的，应当与县(市)人民政府签订基本农田保护责任书，落实保护责任。
集体或者个人承包基本农田的，应当在承包经营合同中载明土地承包经营者对基本农田的保护责任。
第十四条 县级人民政府应当组织农业行政主管部门和土地行政主管部门根据当地实际情况，对基本农田地力进行分等定级，并制定相应的地力保护措施，坚持用地与养地相结合，保持和培肥地力。
第十五条 鼓励农业生产者对其经营的基本农田施用有机肥料，合理施用化肥、农药，保持和提高基本农田地力。
第十六条 县级人民政府农业行政主管部门应当会同环境保护行政主管部门对基本农田环境污染进行定期监测和评价，并制定防护措施。
第十七条 违反本办法规定，有下列行为之一的，依照国家和自治区有关土地管理的法律、法规从重给予处罚：
(一)未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用基本农田的；
(二)超过批准数量占用基本农田的；
(三)非法批准占有基本农田的；
(四)买卖或者以其他形式非法转让基本农田的。
第十八条 拒绝、阻碍土地、农业行政主管部门工作人员依法履行职务，违反《治安管理处罚条例》的，由公安机关按照《治安管理处罚条例》的规定处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
关联法规：全国人大法律（1）条
第十九条 本办法自2000年10月1日起施行。1995年12月1日自治区人民政府发布的《新疆维吾尔自治区基本农田保护办法》同时废止。